Inventaire des recherches

DECLERCK Stephan

CROIX DU SUD 3 BTE 6
1348 LOUVAIN-LA-NEUVE
BELGIQUE

Téléphone : +32 10 47.46.44
Fax : +32 10 45.15.01
E-mail : Stephan.Declerck@uclouvain.be
Site internet de l'unité : http://www.mbla.ucl.ac.be

L'unité de Microbiologie (MBLA) comprend le Laboratoire de Mycologie (MYCO) (Professeur Stéphane Declerck) et le laboratoire de Microbiologie Alimentaire et Environnementale (MIAE) (Professeur Jacques Mahillon).
Les principaux axes de recherches développés au sein de l'Unité sont:
Pour le laboratoire de mycologie : la biodiversité, taxonomie, phylogénie, écologie et physiologie des champignons filamenteux, lévuriens et mycorhiziens à arbuscules. La recherche est focalisée sur deux secteurs; l’agro-alimentaire (ex. taxonomie/identification des champignons et levures dans les aliments, les mycotoxines) et l’environnement (ex. taxonomie/biotechnologie des champignons du bois, bio-fertilisants, bio-remédiation, changements globaux). Le laboratoire de Mycologie abrite la Mycothèque de l’UCL (http://bccm.belspo.be/about/mucl.php), partenaire des Collections Coordonnées Belges de Microorganismes et la Glomeromycota IN vitro COllection (GINCO – http://www.mbla.ucl.ac.be/ginco-bel).
Pour le laboratoire MIAE: L'étude de la flexibilité génétique de bactéries opportunistes et pathogènes, en relation avec leur virulences différentielles (principalement le groupe de Bacillus cereus, Escherichia coli O157:H7 et Listeria monocytogenes). Des méthodes de détection et de discrimination de ces bactéries sont développées sur matrices alimentaires et environnementales. Ces recherches comportent des aspects de valorisation et de service dans le domaine agro-alimentaire.

- Le Laboratoire de mycologie héberge la Mycothèque de l’UCL, qui fait partie des BCCM (Belgian Co-ordinated Collections of Micro-organisms) (http://www.belspo.be/bccm). Fin juin 2005, MUCL a été certifié selon le référentiel ISO9001, version 2000 par SGS. Elle dispose d'un patrimoine riche de 26000 souches vivantes de champignons filamenteux, lévuriens et mycorhiziens à arbuscules et de plus de 40000 souches en herbier. Elle assure la conservation de la diversité fongique mondiale et sa valorisation dans des applications biotechnologiques, industrielles et environnementales avec toutes les recherches liées à l'origine, aux caractéristiques morphologiques, physiologiques et moléculaires. Elle conserve également le patrimoine de tiers tel celui des industriels désireux de préserver leurs souches de productions au travers de dépôts de sécurité ou de brevets.
Elle assure différents services auprès des universités, des industries et des laboratoires.
- Le Laboratoire de microbiologie alimentaire et environnementale fait partie du réseau REQUASUD assurant pour la Région wallonne un service d'analyses et de conseils en matière de qualité microbiologique des aliments.
- Le Laboratoire de microbiologie alimentaire et environnementale a mis sur pied une banque de données des séquences d'insertion procaryotes disponible au travers d'un site Web (ISFINDER) et possède une collection de plus de 1000 souches de Bacillus spp.

- Système intégré HRGC d'identification de souches bactériennes (chromatographie/intégrateur/traitement informatisé/ banque de données).
- Système d'analyse pour les identifications par PCR-RAPD avec traitement informatisé des gels et banque de données.
- Système d'identification des levures automatisé et miniaturisé.
- Microscope électronique à balayage équipé d'un système de cryo-transfert.
- Électrophorèse en champ pulsé (Pulse Field Gel Electrophoresis).
- Séquenceur automatique.(CEQ8000/AFLP)
- Electrophorèse capillaire.
- Electrophorèse en gradient de température (Thermal Gradient Gel Electrophoresis)
- Incubateur agitateur (ambiance +5°C à 60 ou 80°C)
- LPLC Chromatographe basse pression (purification de protéines) avec collection automatique de fractions
- Spectrophotomètre UV-vis haute résolution avec régulation de température par effet peltier de 0 à 110°C.
- Real time PCR
- Fermenteur pilote 10 L + régulation

Champignons mycorhiziens à arbuscules , Champignons filamenteux, Levures, Bacillus, Virulence bactérienne

1) BCCM: BELGIAN COORDINATED COLLECTIONS OF MICRO-ORGANISMS
2) REQUASUD:RESEAU ASSURANT POUR LA REGION WALLONNE UN SERVICE D'ANALYSES ET DE CONSEILS EN MATIERE DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES ALIMENTS.
- COLLABORATIONS INTERNATIONALES
1) ECCO:EUROPEAN CULTURE COLLECTION ORGANIZATION
2) WFCC:WORLD FEDERATION OF CULTURE COLLECTIONS
3) MOSAICC:MICROORGANISMS SUSTAINABLE USE ACCESS REGULATION INTERNATIONAL CODE OF CONDUCT
4) CABRI:COMMON ACCESS BIOLOGICAL RESOURCES INFORMATION NETWORK
5) MINE: MICROBIAL INFORMATION NETWORK EUROPE
6) RÉSEAU DE CONCERTATION BACILLUS CEREUS SENSU LATO
7) COLLABORATIONS INTERNATIONALES AVEC CUBA ET MADAGASCAR
8) COLLABORATION AVEC LE MAROC (COLLECTIONS COORDONNEES MAROCAINES DE MICROORGANISMES
9) COLLABORATION AVEC LE CBS (CENTRAALBUREAU VOOR SCHIMMELCULTUUR)
10) COLLABORATION AVEC LE CAMEROUN, ETHIOPIE ET CHINE

Brevet(s) : oui
Vanhulle, S., Lucas, M., Mertens, V., Gobeaux, B., Bols, C.M., Buchon, F., Wesenberg, B., Agathos, S., Corbisier, A.-M., "Sustainable process for the treatment and detoxification of liquide wastes" WO03035561, (september 2002).
Jonniaux, J-L., Valepyn, E., Corbisier, A.-M., Dauvrin, Th."New fungal species : transformation and expression system" (PCT/BE03/00143, august 2002).


Licences : non

Nombre de chercheurs : 21 - Nombre de PATO : 15

Formation continue : oui
Contact : http://emma.agro.ucl.ac.be/formation